Yayasan Permata Hati Purwokerto awalnya bernama Yayasan Permata Hati yang didirikan pada tanggal 9 Agustus 1997. Sejak berdirinya, Yayasan Permata Hati memiliki kepedulian dalam bidang pendidikan dan sosial kemasyarakatan. Yayasan Permata Hati secara aktif bekerja sama dengan masyarakat menangani berbagai permasalahan sosial terutama yang berkaitan dengan ibu dan anak. Sedangkan dalam bidang pendidikan, Yayasan Permata Hati menggagas dan mencetak konsep pendidikan alternatif di lingkup pendidikan anak usia dini dan pendidikan dasar, yaitu dengan didirikannya Kelompok Bermain Harapan Bunda (1997) dan Taman Kanak-Kanak Islam Terpadu Harapan Bunda (2002). Semua itu adalah sebagai wujud pengabdian dan sumbangsih dari Yayasan Permata Hati kepada masyarakat.
Seiring dengan berjalannya waktu, pada tahun 2008 Yayasan Permata Hati berganti nama menjadi Yayasan Permata Hati Purwokerto. Sesuai dengan visi yayasan yaitu meningkatkan kualitas sumber daya manusia dan dalam rangka mendukung program pemerintah untuk memberikan pelayanan pendidikan yang berkualitas kepada masyarakat, maka Yayasan Permata Hati Purwokerto telah menetapkan untuk mendirikan sebuah Sekolah Dasar dengan nama Sekolah Dasar Islam Terpadu (SDIT) Harapan Bunda pada Tahun Ajaran 2010 – 2011 dan pada Tahun Ajaran 2015 – 2016 Yayasan Permata Hati Purwokerto Mendirikan SMPIT Harapan Bunda.
Peningkatan kualitas sumber daya manusia melalui pendidikan dasar yang berkelanjutan dan pemberdayaan potensi masyarakat.